矮秆波兰小麦矮化基因Rht-dp的精细定位

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株高是影响植物倒伏、收获指数以及产量的重要农艺性状。小麦中,至今发现24个矮化基因(29个等位位点),其中8个来源于四倍体小麦。来源于我国新疆吐鲁番的矮秆波兰小麦(dwarf polish wheat,2n=4x=28,AABB,Triticum polonicum L.)含有一个隐性矮化基因Rht-dp。该基因位于4BS染色体,与4BS上的Rht-B1矮化基因非等位。尽管前期对其进行了初定位,但其遗传距离较大,不利于对该基因的克隆。本研究利用SLAF-seq(Specific-locus amplified fragment sequencing)混池法对重组自交系(F7)植株(极高和极低各30个单株)进行目的区间分析,将Rht-dp定位在4BS染色体上26.64 M区间内。由于该区间多达214个候选基因,不利于候选目的基因的选择。为了进一步缩小目的区域以及减少候选基因数量,利用MISA软件对这214个基因序列进行了SSR序列特征分析,设计获得106对SSR引物。通过多态性分析,仅8对引物用于300个重组自交系单株的定位分析,并将Rht-dp定位于SSR引物Xmgw2F9F-XmgwFF39之间,遗传距离为1.0 cM。所含的55万个碱基中具有6个预测基因,分别为2个未知的基因、Disease resistance protein、GTP-binding protein、NRT1/PTR family和Ubiquitin carboxyl terminal hydroase。
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