目的:掌握云南乙型脑炎病毒的分子特征和基因型，对近30年来分离自云南的19株乙脑病毒进行PrM基因区核苷酸序列测定和分析，为乙脑流行病学分析及防治提供科学依据。 方法:乙脑病毒接种3日龄乳鼠，取发病濒死的乳鼠脑组织经研磨制成上清液，提取核酸，通过RT-PCR扩增PrM-C基因片断，用病毒PrM-C(456～695)区核苷酸序列与国内外不同年代分离的72株各基因型乙脑病毒相应序列作比较，用Woan-Ru Chen建立的方法进行基因型分析。 结果:云南乙脑病毒均可引起3日龄乳鼠在78h之内死亡；核酸序列分析结果显示，19株乙脑病毒中，17株属基因Ⅲ型，2株属基因I型，两株I型病毒与17株Ⅲ型病毒问存在大于15％的差异。分离自不同地区、不同时间、不同宿主的Ⅲ型乙脑病毒核苷酸间仅存在3.8％～5.2％的差异，两株I型病毒间差异也较小。 结论:证实云南省广泛存在基因Ⅲ型和I型乙型脑炎病毒流行，Ⅲ型为主要流行型，不同来源的基因Ⅲ型或I型乙脑病毒间无明显差异，表明乙脑病毒在自然进化中变异不明显。