【摘 要】
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目的揭示2014年至2015年广东地区流行性感冒（流感）H3N2病毒血凝素（HA）基因进化特征及抗原表位变异。方法采用时空抽样方法抽样,检测2014年至2015年广东省分离的17株H3N2病毒HA基因核苷酸序列,下载Gen Bank中36株参考基因序列;比对HA基因核苷酸序列,分析基因氨基酸变异,构建遗传进化树和熵值图;同时分析2014年至2015年广东毒株HA基因的抗原表位变异和选择性。结果以疫
【出 处】
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2016新发传染病研究热点研讨会论文集
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目的揭示2014年至2015年广东地区流行性感冒（流感）H3N2病毒血凝素（HA）基因进化特征及抗原表位变异。方法采用时空抽样方法抽样,检测2014年至2015年广东省分离的17株H3N2病毒HA基因核苷酸序列,下载Gen Bank中36株参考基因序列;比对HA基因核苷酸序列,分析基因氨基酸变异,构建遗传进化树和熵值图;同时分析2014年至2015年广东毒株HA基因的抗原表位变异和选择性。结果以疫苗株A/Texas/50/2012毒株HA基因为基准,2014年至2015年广东地区17株流感毒株HA基因共有25个位点氨基酸置换;HA1基因表位A、B、D和E发生变异,涉及11个氨基酸位点;毒株A/Guangdong/55/2015的HA基因出现N38K变异,减少1个糖基化位点。高突变位点为175位（熵值为1.16）;综合评价SLAC、FEL和IFEL模型筛选结果,可能正向选择位点包括位点363,负向选择位点包括位点368和425。结论广东H3N2病毒HA基因表位A、B、D和E发生变异,进化正向选择位点包括位点363,负向选择位点包括位点368和425;变异累积可能导致流感H3N2病毒疫情流行。
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