玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63负调控基因nsdB的克隆及序列分析

来源 :中国植物病理学会2010年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:luan0778
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本试验根据天蓝色链霉菌A3(2)的nsdB基因序列设计引物扩增Men-myco-93-63菌株的基因组DNA,经测序和序列分析表明,由引物NsBF (5’-GTGGATCGACATGGGAGAGAT-3)和NsBR(5’-CCATGGACAGGTAGTCGAAGAT-3)克隆得到的Men-myco-93-63菌株中的1100bp片段与天蓝色链霉菌A3(2)nsdB基因核营酸序列相似性为86%,与阿维链霉菌MA-4680中nsdB基因核营酸序列相似性为85%,与灰色链霉菌NBRC 13350中nsdB相似性为84%。通过blastx进行氨基酸序列比对分析发现,NsBF和NsBR克隆获得的片段与阿维链霉菌MA-4680和天蓝色链霉菌A3(2)中nsdB基因的氨基酸序列同源性为82%,与灰色链霉菌NBRC13350和变铅青链霉菌TK24中。sdB基因的氨基酸序列同源性为81%,上述结果表明,扩增片段可能为Men-myco-93-63中存在的nsdB基因。扩增体系的反应条件确定为95℃5min,94℃1min,60℃1min,72℃1min30s,35个循环;72℃延伸10min,所用的酶为LA Tap酶,buffer为2×GC I。nsdB基因在玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63中的存在情况将进一步证实,该基因的发现为深入了解玫瑰黄链霉菌的细胞分化和次生代谢调节提供了新的研究启示,也为抗生素高产工程菌株的获得提供了有益的依据。
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