【摘 要】
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萜类化合物是植物次级代谢物中最庞大的类别,在植物生长发育以及与周围环境的作用中都具有重要作用,萜类合成酶(TPS)是萜类化合物合成的关键酶.基于生物信息学的方法,本文对毛竹(Phyllostachysedulis)TPS家族成员进行了鉴定,并就其编码蛋白的理化性质、基因结构、进化关系、功能分化及启动子元件等进行了分析.结果表明,毛竹全基因组含有14个TPS候选基因,大小为693-2439bp,编码
【机 构】
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江西农业大学·江西省竹子种质资源与利用重点实验室,江西 南昌,330045 江西省林业科学院,江西
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萜类化合物是植物次级代谢物中最庞大的类别,在植物生长发育以及与周围环境的作用中都具有重要作用,萜类合成酶(TPS)是萜类化合物合成的关键酶.基于生物信息学的方法,本文对毛竹(Phyllostachysedulis)TPS家族成员进行了鉴定,并就其编码蛋白的理化性质、基因结构、进化关系、功能分化及启动子元件等进行了分析.结果表明,毛竹全基因组含有14个TPS候选基因,大小为693-2439bp,编码蛋白等电点为5.08-8.17;亚细胞定位预测显示,13个毛竹TPS成员能获得信号肽位置,其中6个定位在细胞质;系统发育分析显示,毛竹含有TPS-a、TPS-b、TPS-e/f、和TPS-g4个亚家族,成员数目分别为6,5,2,1;启动子分析获得50个元件,可分为6大类,其中光响应相关元件数量最多,共包含17个顺式调控元件.本研究在全基因组水平上初步分析了毛竹TPS家族的特征和进化关系,为深入分析该家族的功能提供了理论基础.
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