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以硫醚为底物，在磷酸缓冲溶液均相体系中以来自海洋真菌Caldariomyces fumago的氟过氧化物酶催化、过氧叔丁醇氧化定向合成R-莫达非尼。引入离子液体为共溶剂提高疏水性底物的转化率，通过氧化剂的种类、离子液体类型、反应时间、反应体系pH值、氧化剂与底物的配比及酶用量的考察优化反应条件，结果表明35℃，pH为5.5时，以溴化-1-乙基-3-甲基咪唑([EMIM][Br])为共溶剂产率速到(40.8％)，对应选择性(e.e.)96.7％。UV-vis及CD光谱分析表明反应体系中引入少量添加剂时氯过氧化物酶活性中心的血红素辅基暴露程度增加，底物容易接近，同时氯过氧化物醇α-螺旋结构得以加强，从而有效改善了氯过氧化物酶的催化性能。