【摘 要】
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杂色鲍是我国南方重要的海水养殖贝类.为构建杂色鲍的遗传连锁图谱,构建了其肌肉和内脏等全组织的eDNA文库,测序共获得了8016条EST序列,经拼接和去掉重复序列后获得Unige
【机 构】
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中国水产科学研究院南海水产研究所,广州·510300
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杂色鲍是我国南方重要的海水养殖贝类.为构建杂色鲍的遗传连锁图谱,构建了其肌肉和内脏等全组织的eDNA文库,测序共获得了8016条EST序列,经拼接和去掉重复序列后获得Unigene4781条.用SSR Hunter软件,从Unigene中查到173个重复序列,隶属于161个EST,含微卫星的EST数占总EST总数的3.37％.其中双碱基重复序列110个,占约63.6％,三碱基重复序列47对,占约51.8％,其他类型共占约9.2％.选取含有丰富侧翼序列的ESTs,从中设计93对引物,有78对可以扩增,占合成总引物的83.9％,其中有25对引物扩增的片段超出预期的片段.用深圳,汕尾等3个群体中挑选5个个体经聚丙烯凝胶电泳检测,多态性引物19对.经深圳九孔鲍群体(36个个体)来检测,19个位点等位基因数范围2-18个,平均等位基因7.55个每位点.标记转换性测试另外两个养殖品种,除几个位点的少数部分个体不能得到扩增,所以微点都可以在其它两个养殖品种扩增.选取10对引物在三个杂色鲍养殖群体通过聚丙烯酰胺凝胶电泳来检测SSR引物的群体遗传多样性的应用.
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