【摘 要】
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炭疽芽胞杆菌可引起炭疽病.我们利用液相色谱与串联质谱连用的方法对炭疽杆菌的疫苗株A16R的全菌蛋白进行检测.共检测到4246个蛋白,占整个A16R蛋白组数据库的89.4％.其中包括11
【机 构】
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北京生物工程研究所,北京,100071
【出 处】
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第八届全国芽孢杆菌青年工作者学术研讨会
论文部分内容阅读
炭疽芽胞杆菌可引起炭疽病.我们利用液相色谱与串联质谱连用的方法对炭疽杆菌的疫苗株A16R的全菌蛋白进行检测.共检测到4246个蛋白,占整个A16R蛋白组数据库的89.4％.其中包括1148个假想蛋白.同时,我们根据读码框构建A16R理论蛋白数据库,搜库结果显示鉴定到6696个蛋白.通过两数据库搜库结果的比对,我们为A16R的基因组补充了186个基因注释,并且发现了8个基因发生了移码的情况.但是聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)和测序结果表明这些移码情况是由于基因组测序错误造成的.此外,一些通过6框数据库搜库得到的肽段不与目前NCBI数据库中的任何炭疽杆菌注释的蛋白同源,这些肽段可能成为寻找新基因的线索.我们的研究可以为基因组的补充注释以及数据库错误的修正提供方法上的参考.
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