十字花科芸薹属(Brassica)包含多种重要的油用和蔬菜类作物,其中白菜(brassicarapa)和甘蓝(Brassicaoleracea)都是非常古老的传统蔬菜,具有良好的营养价值,在我国多个省份都有广泛的栽培,它们的栽培面积和消费量在中国居各类蔬菜之首,是中国最重要的蔬菜之一。有关这两种蔬菜的全基因组测序工作已被我国科学家分别在2011年和2014年完成,为开展白菜和甘蓝中重要基因家族的全基因组鉴定和分析创造了极好的条件。CCCH型锌指蛋白是指包含有三个半胱氨酸和一个组氨酸残基的典型结构,能与锌离子结合的蛋白。研究表明这些蛋白家族的某些成员在mRNA代谢中起调控作用,在植物的生长发育过程以及对生物、非生物胁迫的响应中发挥着重要作用,但是目前有关芸薹属植物上的CCCH基因家族的研究还没有任何报道。本研究以已知CCCH基序作为检索条件,利用BLAST工具在线查找白菜和甘蓝全基因组中的同源蛋白序列,再用SMART工具来检测找出的蛋白序列中是否含CCCH结构域,以确定每个种的基因组上所含有的CCCH型锌指蛋白基因的数目和名称,然后对其进行染色体定位(制作染色体分布图)、不同种间同源基因横向比较、进化树构建、RNA-seq数据分析、附带功能域分析以及亚细胞定位预测等,然后根据分析结果筛选少数具有代表性成员,利用qRT-.PCR技术分析它们在不同非生物逆境处理(盐、干旱、极端温度)下的表达模式,了解这些成员在植物应答逆境胁迫中的功能和机理。结果表明,虽然白菜和甘蓝的基因组大小不同(分别约为529Mb和696Mb),但从白菜和甘蓝基因组中鉴定到CCCH家族成员数量相近,分别为117个和110个;白菜的117个CCCH基因全部被定位在10条染色体上;甘蓝中只有80个CCCH基因被定位在9条染色体上,而其余30个CCCH基因在染色体上的位置由于目前基因组序列组装还不完整而无法确定;两个种间的同源CCCH蛋白序列高度保守;某些成员具有器官或组织特异表达特性(比如Bo101 9596、Bra007205在根中呈特异性表达;Bo1016392、Bra020507在花中呈特异性表达;Bo1041786、Bra001066在叶中呈特异性表达);有关少数具有代表性CCCH成员在不同逆境胁迫下的表达模式目前正在分析之中。该研究综合分析了白菜和甘蓝中CCCH基因家族成员的相关生物学信息,为进一步了解这些成员在白菜和甘蓝的生长发育及逆境适应过程中的功能奠定了基础;同时也可以帮助筛选有研究和应用价值的候选基因,为利用生物技术在白菜和甘蓝上开展遗传改良提供条件。