大熊猫血液转录组微卫星分析

来源 :第三届中国西部动物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:longsir8481
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  微卫星标记是目前应用较广泛的分子遗传标记之一,EST微卫星对于基因定位和某些疾病的研究更具有特殊意义.我们利用本实验室自主开发的微卫星搜索软件MSDBv2.4对大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)血液转录组中的完美型微卫星序列进行搜索,得到了2~6个碱基重复类型的完美型微卫星序列共16,591个(3-UTR含8,536个,5-UTR含6,199个,CDS含1,856个).总丰度为478.54个/Mbp,总长度为0.29Mb,占总转录组序列长度0.83%.
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