棉花生物信息平台的构建

来源 :全国农业生物化学与分子生物学第十四届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lfm888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
棉花作为我国重要的经济作物和纺织业最主要的原料来源,对其基因组、转录组、表达谱和代谢网络的研究一直受到重视.随着测序技术的快速发展,目前已有四个棉属物种的全基因组完成了测序,并公开了大量的DNA序列、基因结构、转录组、分子标记等生物信息数据.在这种背景下,如何快捷并准确地分析、归纳这些海量数据以用于棉花性状改良和品种培育显得尤为重要.文章以目前最新公布的棉花信息数据为基础构建了一个新的生物信息平台。该平台以Linux,Apache,PHP,MySQL为基础架构,以网页访问的形式作为用户界面,并可公开给全世界的棉花研究同行使用。平台主要分为四个模块:数据搜索、基因组浏览器、同源搜索工具(BLAST)和基因预测工具。各模块之间相互有关联,共同组成一个有机的数据系统。
其他文献
随着中国经济的发展,建筑工程也有了很大的改善.土木工程管理人员应始终与时俱进,突破传统观念,并尽快开发更先进的混凝土技术.当前,在中国的房屋建筑市场中,由于对建筑成本
  棉铃虫(Helicoverpa armigera Hubner)属于鳞翅目夜蛾科,在中国及世界各地广泛分布,是棉花生产最严重的害虫之一.棉铃虫寄主植物有200余种,包括玉米、番茄等重要的粮食和
会议
瓯柑(Citrus Suavissima Harlex Tanaka)是温州地区柑桔传统名果,据史料考查其栽培历史长达一千余年,在长期栽培过程中,瓯柑几经兴衰,特别是近五十年来,在和国内新培育及由
代谢组学是于上世纪末新建立的、距表型最为接近的一门学科,其研究对象大都是分子质量在l000Da以内的小分子物质.烟草作为模式植物和经济作物,其代谢组的研究对于植物基础科
会议
  棉花是世界范围内最重要的经济作物,其纤维为纺织工业提供重要的再生原料,种子为人类生活提供优质的食用油。"源-流-库"是作物产量形成的重要理论基础,源强、库大、流畅
番茄灰霉病是造成番茄减产、品质下降的一种世界性重要病害,该病主要危害果实造成烂果,一般危害造成减产20%~30%,严重时高达50%以上,对番茄的农业生产构成极大威胁.目前,我国番茄
会议
题记:日月从诸神的口袋里随意掏出,无限延伸的旷野。那里天高地阔男人健美,女人妖冶。那里黄金铺地,宝石满山。无边无际的奇花异草之间珍禽异兽在飞翔和游荡……欧罗巴人种的
近年来,社会经济飞速发展,科学技术也呈现蓬勃的发展态势,民众在居住生活品质方面提出更高层次的要求,不仅要求住得舒心,更要求住得放心,城市化进程的进一步加快推动了人防工
基于《中等职业学校英语教学大纲》的要求,列举了在实际教学过程中运用头脑风暴的具体实例,探讨如何将头脑风暴巧妙引入中职英语课堂,成为强有力的活力剂。 Based on the re
谷世臣是一个地道的山里人。娶妻生女的他,本可以在小兴安岭深处的那个林场里安稳地当他的林业工人兼代课教师。终于有一天,树采光了,山秃了。最后连他家世传的养蜂业也被一