基于iTRAQ技术筛选食管鳞状细胞癌相关蛋白质

来源 :中国毒理学会第六届全国毒理学大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:csharpguy2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的 筛选食管鳞状细胞癌(ESCC)血浆相关蛋白质,识别相关标志物用于食管癌的早期发现与诊断.方法 选取病理或内镜诊断明确的原发性ESCC患者血浆样品28例,按1∶1配对原则,选取性别相同、年龄相差±5岁、除消化系统疾病以外,同地区非肿瘤人群血浆样品28例作为对照.将血浆样品按样品来源7个一组混合成8例样品,利用安捷伦MARS系统去除样品中的14种高丰度蛋白后,采用GE公司的2-D定量试剂盒对其进行蛋白定量.封闭、酶解后用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术对8例样品进行标记,ESCC组分别标记为113,114,115,116;健康对照组分别标记为117,118,119,121.采用强阳离子交换色谱(SCX色谱)对样品进行分离纯化,液相色谱-串联质谱进行检测分析.运用ProteinPilot软件对数据进行分析处理,对Swiss-Prot protein数据库进行检索查询,对所得肽段进行分析鉴定及相应的统计学分析,利用MS/MS中同一肽段不同报告基团的比值来进行相对定量,从而进行差异蛋白的筛选.对比查询gene ontology数据库和KEGG pathway数据库,对差异蛋白进行GO分析和pathway分析.结果 利用iTRAQ技术与串联质谱相结合的分析方法筛选得到ESCC与健康对照蛋白质共237个,在ESCC组和健康对照组差异表达的蛋白质为19个,其中在ESCC中上调的蛋白质为4个,分别为细胞外基质蛋白1、抗凝血酶因子3、软骨寡聚基质蛋白、白蛋白;在ESCC中下调的蛋白质为15个,分别为人类补体因子H相关蛋白1、间-胰蛋白酶抑制因子重链H4、C4补体结合蛋白、丛生蛋白、基膜聚糖、载脂蛋白2、果糖二磷酸醛缩酶及IGHA2、IGLC2、IGHA1、IGKC、lg heavy chain Ⅴ-Ⅲregion BRO、lg kappa chain Ⅴ-Ⅱregion TEW、lg kappa chain Ⅴ-Ⅰ region Walke、Ig heavy chain Ⅴ-Ⅰ region V35等.GO分析与PATHWAY分析结果提示,19个差异表达蛋白质主要参与免疫、细胞粘附、代谢、应激反应、细胞凋亡等过程.其中COMP,ECM-1和LUM这三个细胞外基质蛋白被多项研究证实其与肿瘤的发生发展进程及预后关系密切,本研究发现ESCC患者血浆中这些蛋白表达异常,可能通过参与粘着斑通路、TGF-β信号通路、ECM受体通路等过程的调控参与食管癌的发生发展.结论 利用蛋白质组学技术初步获得食管鳞状细胞癌血浆相关蛋白质谱,可能成为候选蛋白标志物用于食管癌的早期发现与诊断.
其他文献
WF-340自动倾卸车附有液压升降装置,为林区主要筑路、养路机械之一。我们在使用中发现,其车架断裂是个较为严重的问题。车架一经断裂,不仅经济上造成损失,修复比较困难,而且
  目的 本研究将明确低剂量六溴环十二烷(HBCD)暴露的生物效应,以PI3K/Akt通路与Nrf2-ARE通路为主线研究低剂量HBCD对细胞增殖及氧化应激的调控机制,并进一步探索PI3K/Akt
会议
远望,像一把把扬撒在海滩上的小米粒,随着海浪在一进一退地滚动着,近看,这些成群结队的小矶鹞在“赶海”。当海水向岸边推进时,为躲避海浪,它们拼命的逃跑,当海水退却时,它们
  三甲基氯化锡(TMT)是甲基硫醇锡热稳定剂合成过程中产生的一种剧毒物质,遇热易挥发,具有脂水两溶性,可经呼吸道、消化道、皮肤进入人体引起中毒事故的发生.目前全球已发生TM
会议
  目的 鉴定丁硫克百威的水解产物,研究温度和pH对其水解的影响,并推测可能的降解途径和机理.方法 丁硫克百威1 mg/mL、克百威99.8%.在不同pH值(5,7和9)和温度(25℃,37℃,50
会议
通过对阿坝州J幼儿园普通话教育教学活动的研究,发现阿坝州幼儿园的普通话教育存在教学方式不当、教育管理薄弱和家长消极配合的问题.造成这些问题的主要原因是幼儿园师资力
调查发现,几乎80%的人,一生的某个阶段都体验过腰痛的滋味。俗话说:病人腰痛,医生头痛。由此可见,对于腰痛症状的治疗,也并非一件容易的事。引发腰痛的原因很多,而有很多原因
Glioblastoma(GBM,WHO grade Ⅳ) is the most common and the most malignant primary brain tumor occurring during adulthood,with an annual incidence of 5 cases per
老年人梳头的目的并不仅在于美容,它还有保健作用。首先,梳头是保护头发的好方法。据研究,反复梳头,可刺激头皮末梢神经和毛细血管,促进血液循环。此外,梳头也是促进大脑运
1933年5月,邓小平同志在中央苏区由于坚持毛泽东的正确路线,而受到王明“左”倾错误路线的打击和排挤,被撤销了中共江西省委宣传部部长职务,给予“最后严重警告”处分,并派往乐安县南村区委当巡视员,这是邓小平同志政治生涯中的第一次挫折。后在王稼祥、贺昌的支持下,调任红军总政治部秘书长,同年8月又降为总政治部宣传干事,接任《红星》报的主编工作。面对这场错误的党内斗争,邓小平同志继续坚定不移地履行一名共产