【摘 要】
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本研究用MISA软件对两个姜花转录组中大于1Kb的33373个Unigenes进行SSR位点搜索.在白姜花Hedychium coronarium转录组中搜索到3028个,平均6.9Kb分布一个SSR位点,红姜花H.coccineum转录组中搜索到6840个,平均6.4Kb分布一个SSR位点,两个转录组的优势基序类型均为A/T,GA/TC.对40个长于20bp的SSR位点设计引物,以白姜花和红姜花
【出 处】
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广东省园艺学会第十一届会员大会暨广东园艺产业创新与发展学术研讨会
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本研究用MISA软件对两个姜花转录组中大于1Kb的33373个Unigenes进行SSR位点搜索.在白姜花Hedychium coronarium转录组中搜索到3028个,平均6.9Kb分布一个SSR位点,红姜花H.coccineum转录组中搜索到6840个,平均6.4Kb分布一个SSR位点,两个转录组的优势基序类型均为A/T,GA/TC.对40个长于20bp的SSR位点设计引物,以白姜花和红姜花为材料进行PCR扩增,初步筛选出22对较清晰且稳定性较好的引物,可用于姜花属植物的遗传多样性分析、不同种后代的杂种鉴定以及构建群体遗传图谱等.
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