Core和NS5B直接测序法对丙型肝炎病毒基因分型的影响

来源 :第四届晋冀鲁豫肝病论坛暨2016年河南省医学会感染肝病学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dgjjtjn
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  目的:Core和NS5B区核酸变异程度不同,扩增效率和HCV分型结果存在一定差异,本研究分析两基因区直接测序法的敏感性和准确性.方法:收集慢性丙型病毒性肝炎患者血清51份,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对Core和NS5B区分别扩增,产物直接测序,应用生物学软件构建进化树进行基因分型.结果:51份样本中,Core区扩增阳性为49份(96.1%),共检出5种基因亚型:1b (61.2%,30/49)、2a (20.4%, 10/49)、2b (2%, 1/49)、3a(4.1%,2/49)、6a(12.2%,6/49).NS5B区扩增阳性为45份(88.2%),基因分型结果与Core区完全一致.结论:与NS5B区相比,Core区引物设计易,扩增效率和分型成功率较高,可作为HCV基因型流行病学调查和临床研究的优先选择.
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