简化RACE方法测定基因III、VIb和VIId型新城疫病毒leader和trailer序列及分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第二次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shanlai_lu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:利用cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplificalion of cDNA ends,RACE)测定基因Ⅲ、VIb和VIId型新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)基因组两侧末端序列,并对NDV的leader和trailer进行分析。 方法:利用T4 RNA连接酶将特定寡聚核苷酸片段的连接于病毒基因组RNA和cDNA,再利用RT-PCR或PCR方法对病毒基因组的末端进行快速的扩增。 结果:建立一套操作简单、低成本、可重复性高的RACE方法,测定了三种基因型5株NDV 3’末端leader和5’末端trailer序列比对分析 结论:本实验测定的鹅源Ⅶ型毒株JS/7/05/Ch基因组的15,184nt由一个T变为了C,5’端trailer与3’端leader的连续互补序列由8 nt变为12 nt,而其它4株基因Ⅲ型和Ⅵ型NDV均未发现该突变。通过RNA的二级结构分析,NDV基因组和反向基因组RNA的3’末端形成-个发卡结构。JS/7/05/Ch等3株NDV U→C(T→C)的突变位于发卡环上,不影响二级结构的形成,发卡环的RNA序列突变为3’-UCUC-5’,与基因组3’端发卡环的3’-UCUUA-5’相似,推测可能影响了基因组RNA的复制速度。
其他文献
运用PCR重叠延伸技术将传染性法氏囊病病毒(IBDV)多表位5e与VP2基因连接构建组合基因VP2-5e,将其插入到杆状病毒表达系统供体质粒pFastBacHT中,转化E.coli DH10Bac感受态细胞,经三抗性筛选获得重组杆状病毒表达质粒pBactHT-VP2-5e,用脂质体法转染Sf9细胞,获得重组杆状病毒vBacHT-VP2-5e。对vBacHT-VP2-5e感染的Sf9细胞,以间接免疫
目的:制备针对新城疫病毒F48E9株单克隆抗体,以用于NDV抗原变异研究及检测方法建立。方法:用新城疫病毒F48E9株全病毒及原核表达的重组F48E9-NP蛋白免疫BALB/c小鼠,全病毒间接ELISA筛选杂交瘤细胞株。用免疫印迹和间接免疫荧光试验鉴定单抗反应原性,间接ELISA试验鉴定单抗与其他NDV毒株的交叉反应,并采用NP蛋白分段融合表达技术对单抗识别区域初步定位。结果:共筛选到3株单抗杂交
目的:为了解广东省目前规模化猪场H1和H3亚型猪流感病毒的流行情况,方法:我们采用ELISA的检测方法对采集于广东省14个市的28个规模化猪场的1 015份猪血清进行H1亚型和H3亚型猪流感病毒的抗体检测。结果:结果表明,H1亚型抗体总阳性率为40.9[%],猪场阳性率高达92.9[%](26/28);H3亚型抗体总阻性率为16.8[%],猪场阳性率为78.6[%](22/28)。其中粤西和珠三角
对2009年广东省各地采集到的犬脑及对应唾液腺进行检测,分离到2株狂犬病病毒。测定GD01和GD02株N基因核酸序列,并对其核苷酸差异做了比较分析。病毒对相邻广西等地区序列进行比较,相似性相似性在97.9~99.4[%]之间。与疫苗株相似性在87.8~88.1[%]之间。说明狂犬病病毒流行存在明显的地域现象及存在犬只健康带毒现象。
为了分析狂犬病病毒(RABV)感染细胞后的蛋白质组变化,本试验利用不同毒力的狂犬病病毒株(SRV9、CVS-11、BD06)分别感染N2a细胞,对感染48小时后的细胞进行2-DE电泳,并和未感染N2a细胞比较,通过对差异蛋白质点的质谱(MALDI-TOF-MS/MS)分析和部分差异蛋白的westernblotting验证,结果发现感染48h后,不同毒力狂犬病病毒感染的N2a细胞之间共出现41个蛋白
本研究参考中国T1株序列设计两对引物,从新鲜的猪粪便中扩增戊型肝炎病毒(HEV)部分基因片段,长为1725bp,位于ORF2 205bp-1929bp,命名为HEV ORF2-A。其后根据HEV ORF2-A序列设计三对引物分别扩增HEV ORF2-A三段连续的基因片段,命名为HEV ORF2-B1、HEVORF2-B2、HEVORF2-B3,分别位于HEVORF2205bp-780bp(69 a
猪是乙型脑炎病毒重要的储存和越冬宿主,在人乙型脑炎流行中扮演着重要的作用。在本研究中,利用RT-PCR技术从2009年山西运城某猪场疑似乙型脑炎仔猪脑组织扩增出乙型脑炎病毒prM和E基因,并通过BHK-21细胞传代,分离到一株病毒。间接免疫荧光和RT-PCR进一步证实该病毒为猪源乙型脑炎病毒,并命名为SX09S-01。根据prM基因绘制的进化树表明SX09S-01毒株属于基因I型,E基因与SA-1
利用反向遗传操作系统拯救出狂犬病毒的携带双G基因的HEP-dG株,选用新型佐剂制成狂犬病灭活疫苗,进行小鼠免疫试验、比格犬最小免疫剂量试验。试验表明,携带双G基因的HEP-dG株具有良好的免疫原性,该新型佐剂狂犬病灭活疫苗免疫效果较好,具有完全的保护力。
目的:检测LTB基因在乳腺炎核酸疫苗中是否可起到免疫增强的效果。方法:制备两种质粒pcDNA3.1-FnbpA和pcDNA3.1-LTB-FnbpA,经鼻黏膜免疫小鼠,用间接ELISA法检测抗体水平,及进行攻毒比较。结果:含有LTB基因的实验组抗体水平显著高于对照组(P<0.05),攻毒结果显示其保护率也显著高于对照组(P<0.05),保护率增强了15.64[%]。结论: LTB基因可增强乳腺炎核
试验仔猪在21日龄时注射1ml免疫核糖核酸(含RNA1mg),然后按常规免疫程序进行猪瘟、伪狂犬和口蹄疫等免疫,并分别在免疫前和免疫后二周采血检测免疫抗体、同时在14周龄采血检测伪狂犬野毒抗体和蓝耳病感染抗体。结果显示试验组的三种免疫抗体分别比对照组提高了18、10和18个百分点,伪狂犬野毒抗体试验组比对照组下降了17个百分点、蓝耳病感染抗体试验组比对照组下降了42个百分点。二组间差异显著。