两株沙漠细菌Pontibacter korlensis和Pontibacter akesuensis的trans-omics研究

来源 :第十六次全国环境微生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kkkdddz
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  塔克拉玛干沙漠位于南疆塔里木盆地,是中国最大的沙漠,也是全世界第二大流动沙漠.地处欧亚大陆的中心,四面为高山环绕,系暖温带干旱沙漠,酷暑最高温度达67.2℃,昼夜温差达40℃以上;平均年降水不超过100 mm,最低只有4 mm~5mm;而平均蒸发量高达2500mm~3400mm.全年有三分之一是风沙日,大风风速每秒达300m.由于整个沙漠受西北和南北两个盛行风向的交叉影响,风沙活动十分频繁而剧烈,流动沙丘占80%以上.变幻多样的沙漠形态,丰富而抗盐碱风沙的沙生植被,蒸发量高于降水量的干旱气候,以及尚存于沙漠中的湖泊、穿越沙海的绿洲、潜入沙漠的河流、生存于沙漠中的野生动物和飞禽昆虫等,特别是与这些气候、环境等生存条件相适应的微生物群落与种类等微生物资源有待于人们去探寻.本研究从塔克拉玛干沙漠分离到两株细菌,进行基因组和转录组的联合分析,以解释其耐旱、昼夜温差超过40度、耐盐耐碱、抗辐射和缺少营养的分子生物学机理.和P.akesuensis基因组大小分别为4.73和4.05Mb,GC含量为48.48%和52.45%,利用基因预测得到的蛋白序列和功能信息,得到两株菌差异蛋白主要富集于遗传信息的加工和代谢等(相差2-8倍),且P.korlensis有很多的Insertion sequences (IS)和Genomies islands (GEI),而P.akesuensis较少.利用不同辐射条件下的基因表达情况和细胞代谢产物分析,推测出整合酶/重组酶、转座酶和半乳糖胺的整体调控网络.以上结果证实:通过多组学的数据可有效挖掘极端微生物的抗性基因和机制,从而推导出整体调控系统,为挖掘和应用珍贵的基因资源提供参考的研究思路和指导.
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