【摘 要】
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植物重组是产生遗传变异的重要来源之一,研究植物中染色体片段长短及其分布对大豆育种有重要的指导意义。用数学理论推算片断大小是一个极其复杂的过程,本研究利用R语言模拟
【机 构】
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河北省农林科学院粮油作物研究所/河北省作物遗传育种实验室/国家大豆改良中心石家庄分中心/农业部黄淮海大豆生物学与遗传育种重点实验室;
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植物重组是产生遗传变异的重要来源之一,研究植物中染色体片段长短及其分布对大豆育种有重要的指导意义。用数学理论推算片断大小是一个极其复杂的过程,本研究利用R语言模拟大豆生成配子、杂交(或自交)、产生下代的整个过程,避开复杂的数据推导过程,可以模拟一个给定数量的自交群体、回交群体或其它杂交类型群体的任意世代的个体基因型。程序过程由一系列函数构成,主要有染色体位点交换函数、随机交换位点函数、配子产生函数、配子自交函数等系列函数。若设为母本基因为0、父本基因2,则后代群体基因型为一个由0,1,2构成的矩阵。可根据所产生的数据模拟控制某一性状的多个基因位点在加性、显性、互作等情况下的遗传表现及确定目标性状最优选择模型。利用SNP数据建立的高密度大豆遗传图谱为测试数据产生自交F9后代,经计算模拟数据遗传距离与图谱距离差异不显著,证明重组模拟可客观的反应植物重组过程。
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