驯食饲料的大口黑鲈SNPs筛选及其与生长性状的关联分析

来源 :2015年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:allenwyh
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  以人工饵料代替冰鲜杂鱼培育肉食性经济鱼类一直是研究者探索的热点之一,而从转录组水平对大口黑鲈的食性适应性研究仍未开展,本研究以食用冰鲜和配合饲料的同批大口黑鲈为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术,对其转录组进行测序,以分析食性对功能基因表达的影响,筛选相关的SNPs 分子标记.结果共筛选出7227 个大口黑鲈SNPs 位点,挑选其中具有表达差异的50个SNPs 位点进行SNaPshot 分型,其中39 个分型成功,而成功分型的位点中有4 个为假阳性,通过RNA-Seq 技术开发出SNPs 标记35 个,成功率为70.0%.为进一步验证这些标记与性状的相关性,我们以327 条食用人工配合饲料的大口黑鲈选育鱼为检测对象,进行SNPs位点的生长性状关联分析,结果发现2 个SNPs 位点与体质量、全长、体高等生长性状存在显著相关性,可用于大口黑鲈的分子辅助育种.本研究证实了从转录组数据开发SNPs 标记的可行性,也为大口黑鲈驯食相关的遗传育种研究提供了有用分子标记.
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