【摘 要】
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为分析2012年河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的特异性引物,利用RT-PCR方法,对2012年分离的5株PEDV毒株的S1基因进行扩增、克隆和序列测定,并对其进行遗传进化分析。结果表明:5株PEDV S1基因核苷酸同源性为98.3％～99.5％,氨基酸同源性为97.1％～98.9％。与2012年国内登陆的PEDV流行株相比较核苷酸同源性为97.8％
【机 构】
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河南农业大学牧医工程学院,郑州,450002 河南省动物疫病预防控制中心,郑州,450008
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜传染病分会第八次全国会员代表大会暨第15次学术研讨会
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为分析2012年河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的特异性引物,利用RT-PCR方法,对2012年分离的5株PEDV毒株的S1基因进行扩增、克隆和序列测定,并对其进行遗传进化分析。结果表明:5株PEDV S1基因核苷酸同源性为98.3％～99.5％,氨基酸同源性为97.1％～98.9％。与2012年国内登陆的PEDV流行株相比较核苷酸同源性为97.8％～99.2％,氨基酸同源性为97.4％～99.1％。与参考毒株CV777相比较核苷酸同源性为88.7％～89.1％,氨基酸同源性为87.3％～88.4％。同源性分析结果表明:5株分离株S1基因变异情况基本一致,存在相同的插入和缺失,并且与国内2012年登陆的毒株相比没有突变倾向;但与参考毒株CV777相比较,在第163bp～166bp处有3个核苷酸插入,在173bp～174bp之间有9个核苷酸插入,在405bp～406bp之间有3个核苷酸插入,在463bp～464bp之间有3个核苷酸缺失,这些位点核苷酸的插入和缺失导致了其编码的氨基酸相应改变。PEDV S1基因在我国只有一个血清型,但PEDV分3个群,系统进化树分析表明5株分离株S1基因与2012年国内登陆的毒株均属于Ⅲ群,与2011年国内登陆的PEDVⅠ群流行毒株相比较核苷酸同源性为88.6％～89.3％,氨基酸同源性为85.3％～86.9％,而参考毒株CV777属于Ⅱ群。目前我国流行的PEDV S1基因有PEDV群和Ⅲ群的存在,但这些毒株的致病性和抗原性差异仍有待进一步研究。
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