【摘 要】
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本研究对一株猪口蹄疫亚洲1型分离株的主要抗原基因VP1进行了扩增和测序,并与国内外报道序列进行同源性比对,结果与国内报道株同源性在83.3％-86.4％之间,而与国外报道株的同源性在24.8％-98.4％。进化树分析发现其为国内报道株的一个新的分支,因此其来源可能为变异株或外来毒株.采用Garnier-Robso法、Chou-Fasman法、Karplus-Schultz法对VP1进行二级结构分析
【机 构】
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四川农业大学动物科技学院,雅安,四川,625014 四川大学“985工程”西南资源环境与灾害防治科
【出 处】
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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十二次学术研讨会
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本研究对一株猪口蹄疫亚洲1型分离株的主要抗原基因VP1进行了扩增和测序,并与国内外报道序列进行同源性比对,结果与国内报道株同源性在83.3％-86.4％之间,而与国外报道株的同源性在24.8％-98.4％。进化树分析发现其为国内报道株的一个新的分支,因此其来源可能为变异株或外来毒株.采用Garnier-Robso法、Chou-Fasman法、Karplus-Schultz法对VP1进行二级结构分析,采用Kyte-Doolittle法分析氨基酸序列亲水性、Emini法预测特定区域位于蛋白质表面的可能性、Jameson-Wolf法预测各结构蛋白的抗原指数,最后获得VP1结构蛋白的B细胞抗原表位。通过对二级结构的分析和与国内报道序列的比较,发现该株病毒VP1基因具有较高的抗原表位区域。
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