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本文以2008年度中国民营上市公司为研究对象，利用灰色关联理论进行实证研究。通过追溯上市公司的终极股东，分别从行业和控制方式两个维度系统考察终极所有权、控制权以及两权分离度的状况。按照不同的行业维度，采用关联分析法实证考察两权分离度与公司治理绩效之间的关系。实证结果表明：终极股东的所有权与控制权平均存在9.30的偏离度；终极股东选择不同的方式控制上市公司，在金字塔控制结构下，两权分离度最大，达到11.53。同时，不同的行业特征条件下，终极所有权、控制权以及两权分离度有较大的差异；不同行业的民营上市公司的治理绩效差异也比较显著。通过灰色关联度分析，发现两权分离状况对上市公司治理绩效的影响十分显著。