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[期刊论文] 作者:陈润生,倪向善, 来源:生物物理学报 年份:1989
本文练合使用了Monte Carlo(MC)方法;互洽场(MCF)方法和从头计算的晶体轨道(ab initio CO)方法,首先研究了无限周期的多聚α-门冬酰胺的水溶液结构.进而,研究了该水结构对多...
[期刊论文] 作者:陈润生,倪向善, 来源:科学通报 年份:1982
本文研究了由分子构型所导致的平移扩散的变化对所合成蛋白质的动力学结构的影响,并得到了明确的结果。一、方法我们曾给出球型分子的反应扩散方程,为了模型研究的简化,我们...
[期刊论文] 作者:陈润生,倪向善,, 来源:分子科学与化学研究 年份:1982
为了了解手性分子的相互作用,我们通过改变单体间的距离计算了 L-LAlanine 和 L-D Alanine 二体系统的相互作用能.发现 L-L Alanine 二体的能谷较深,L-L 二体与 L-D 二体的能...
[期刊论文] 作者:陈润生,倪向善,, 来源:分子科学学报 年份:1982
本文将作者曾提出的受精卵中蛋白质合成的反应动力学模型推广到旋转椭球形分子的情形.考察了分子构型的变化对蛋白质定态结构的影响.发现这种影响是显著的,当分子构型与球形...
[期刊论文] 作者:倪向善,陈润生,石秀凡, 来源:生物物理学报 年份:1993
提出了一种部分力偏倚蒙特卡罗模拟方法,其中力偏倚仅用于体系中每个分子质心的平动而不用于分子的转动.此方法的总体效益较之先前几种方案为佳,同时报导了该方法在自由能微...
[期刊论文] 作者:石秀凡,叶国辉,倪向善,, 来源:分子科学学报 年份:1984
许多实验业已表明生物分子在溶液状态时,其近邻的水分子是形成一定结构的。这些水分子在维持生物大分子的构象和发挥生物分子的功能中起着重要作用。本文选用了含有带电基团...
[期刊论文] 作者:凌伦奖,石秀凡,倪向善, 来源:科学通报 年份:1988
在生物学研究中,经常要寻找生物分子的最低能量状态,常用的是能量优化方法。一般地说,即使不加溶剂分子,生物分子本身的构象变化自由度也较大,因而其能量函数有众多的局部极...
[期刊论文] 作者:倪向善,陈润生,石秀凡, 来源:科学通报 年份:1986
水是活细胞中含量最高的成分,它对于维系蛋白质的天然构象和一系列特性有着重要的作用,研究蛋白质中水的结构对于全面了解蛋白质的结构与功能的关系有重大的意义。从理论上...
[期刊论文] 作者:倪向善,陈润生,石秀凡, 来源:中国科学(B辑 化学 生物学 农学 医学 地学) 年份:1985
本文对由五十六个水分子包围一个中性的丙氨酸分子所构成的分子集团做了MC模拟计算。求出了水—水和氨基酸—水的平均相互作用能。将丙氨酸分子周围的空间划分为三个区域——...
[期刊论文] 作者:凌伦奖,倪向善,陈润生,石秀凡, 来源:生物物理学报 年份:1989
本文在细菌视紫红质构象模拟的基础上提出了一个视黄醛顺反异构模型.该模型中视黄醛的C_(13)—C_(14)与Lys—216的C~δ—C~e处于一直线上,这样,顺反异构只涉及视黄醛C_(15)和...
[期刊论文] 作者:陈润生,王化军,倪向善,石秀凡, 来源:生物物理学报 年份:1990
膜蛋白的结构预测目前还十分困难.本文以两个典型的膜蛋白为选材,用神经网络方法对其二级结构做了预测.预测结果与实验资料的符合率与该方法用于球蛋白时的结果一致,因此是较...
[期刊论文] 作者:石秀凡,凌伦奖,倪向善,陈润生, 来源:科学通报 年份:1986
当前用于确定生物大分子结构的基本的可靠的方法是X射线晶体衍射,但它并不能肯定大分子的全部结构。例如对胰岛素B链的第4个残基谷氨酰胺和第22个残基精氨酸国外报道都有取...
[期刊论文] 作者:凌伦奖,倪向善,石秀凡,王化军,陈润生, 来源:生物物理学报 年份:1990
本工作分两个阶段,第一阶段用从头算方法计算纳氨酸两性离子同处于160种不同位置的水分子的相互作用能,计算时采用最小基组并进行了基组重叠修正,最后还对计算得的相互作用能...
[期刊论文] 作者:王化军,凌伦奖,倪向善,陈润生,石秀凡, 来源:生物物理学报 年份:1990
本文报道了我们使用分子动力学方法模拟胰凝乳蛋白酶原激活过程的研究.使用我们所提出的虚拟势法,通过对不加虚拟势和加大小不等的虚拟势的几种情形的模拟和比较,对于激活过...
[期刊论文] 作者:凌伦奖,倪向善,石秀凡,王化军,陈润生, 来源:科学通报 年份:1991
用理论方法研究生物分子的水溶液时,常要用到水和生物分子的相互作用势。在水和氨基酸的相互作用势方面,关于中性氨基酸的研究目前已有很多,而关于氨基酸两性离子的研究却相...
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