近年来，国家税务总局对增值税发票管理提出的要求愈加严格，增值税作为主要税种，在财政税收中作用突出，增值税发票在企事业单位中得到广泛应用，并作为企业税务筹划的主要依据。在当前市场环境中，一些纳税人在利益的驱使下钻法律“漏洞”，以发票为获利工具实施违法行为，严重破坏国家税收秩序，造成恶劣的社会影响。事业单位是承担政府职能的机构，其应当做好社会表率，规范以票控税行为，坚决防范和制止发票违法等行为，严格执行增值税发票风险管理控制，压缩增值税发票违法空间。文章主要围绕事业单位增值税发票风险管理展开研究，以当前发票管理的内外环境入手分析，从获取发票和开票两个角度分析增值税发票风险，最后结合实际情况提出管理增值税发票风险的实际措施，旨在于强化事业单位增值税发票风险管控质量，减少增值税发票违法违纪等行为。