【摘 要】
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为了解新疆额尔齐斯河流域野生鲤鱼肠道细菌的多样性及其群落结构组成,采用高通量测序技术对鲤鱼肠道中细菌16S rRNA V4区基因进行检测,并比较鲤鱼肠道不同区段中细菌群落结
【机 构】
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石河子大学食品学院,江南大学食品学院
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（31360001）
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为了解新疆额尔齐斯河流域野生鲤鱼肠道细菌的多样性及其群落结构组成,采用高通量测序技术对鲤鱼肠道中细菌16S rRNA V4区基因进行检测,并比较鲤鱼肠道不同区段中细菌群落结构组成及多样性,结果共获得35 289条有效序列,158个OTUs。多样性分析表明,鲤鱼后肠的Shannon指数最低,细菌群落结构最为复杂;而前肠和中肠的Shannon和Simpson指数接近一致。在门水平上,鲤鱼肠道样品中主要以厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门为主,前肠和中肠中变形菌门是最占优势的菌群门,而后肠中变形菌门比例减少
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