目的分析上海市松江区手足口病流行病学及病原学特征,为开展手足口病科学防制提供依据。方法自国家疾病预防控制信息系统收集松江区2012-2016年手足口病监测资料,采用描述流行病学方法进行分析。结果 2012-2016年,松江区累计报告手足口病病例24 292例,重症病例90例,死亡病例1例,年均发病率为282.43/10万。松江区手足口病发病呈现双峰分布,4-7月为主高峰,11-12月为次高峰。松江区各街镇均有病例报告,主要集中在九亭镇、泗泾镇、新桥镇等城郊结合部;男性发病高于女性,性别比为1.54∶1;普通病例以5岁及以下儿童为主(89.10%),重症病例以3岁以下儿童为主(87.78%)。2012-2016年,松江区共报告手足口病确诊病例908例,EV71、CA16及其他肠道病毒阳性率分别为22.69%、43.39%、33.92%;重症病例EV71阳性率为95.40%。结论松江区手足口病发病呈现明显的季节、地域及人群分布特征,且不同年份优势病原存在交替变化。应继续加强松江区手足口病疫情及病原学监测,为进一步制订手足口病防控措施奠定数据基础。