提高农业绿色全要素生产率是实现农业高质量发展的必由之路，也是落实绿色发展理念和推进农业现代化转型的题中之义。在测度农村普惠金融发展水平和农业绿色全要素生产率的基础上，运用空间杜宾模型和调节效应模型实证检验了农村普惠金融、人力资本对农业绿色全要素生产率的影响效果。研究发现：农村普惠金融能够显著提升本地区与相邻地区农业绿色全要素生产率；人力资本积累有利于提升相邻地区农业绿色全要素生产率，但对本地区农业绿色全要素生产率的提升无显著影响；人力资本水平越高，农村普惠金融对农业绿色全要素生产率的提升效果越明显，且具有空间溢出效应。进一步研究发现，农村普惠金融的发展主要通过提高农户对金融业务接纳度来推动本地区农业绿色全要素生产率提升。在农村普惠金融对农业绿色全要素生产率的空间溢出效应中，增加金融覆盖密度、改善金融使用情况以及提高金融服务效率均有利于相邻地区农业绿色全要素生产率提升，促进效果依次减弱。因此，深入发展农村普惠金融，以人力资本为载体，重点培育金融服务型人才、构建农村普惠金融与人力资本的协同发展机制是实现农业绿色全要素生产率全面提升的优选之路。