应用ImageJ程序包进行材料显微组织图像处理、分析和可视化的一种框架(英文)

来源 :中国体视学与图像分析 | 被引量 : 17次 | 上传用户:hitsanmao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
显微组织图像(例如胞、粒子与晶粒等)的数字图像处理、分割和分析,对于获取显微组织特征的三维信息非常重要。已有数种商用和共享程序包可以用于图像的处理和分析。"ImageJ"即其中之一,其长期广泛采用及其可扩展插件形式已使其成为许多不同应用领域科学家选用的工具。它包含了处理、分割、重建和可视化材料显微结构所需要的几乎所有基本的和最新的功能以及图像分析工具(例如‘Particle Analyzer’,‘3D object counter’,‘3D Roi Manager’),以用于成组粒子的复杂统计处理。
其他文献
提出了一种新的图像边缘检测算法,该算法融合了非下采样轮廓波变换与数学形态学方法来实现图像的边缘检测.首先,源图像被非下采样轮廓波变换分解成多尺度、多方向子带;然后,分别采用双阈值模极大值算法和数学形态学方法提取高频与低频子带的边缘信息;最后,综合高频、低频子带边缘信息,得到源图像全部的边缘信息,并进行细化,剔除孤立点,获得源图像的边缘.仿真实验结果表明:新算法能够有效抑制噪声,去除伪边缘,一定程度
期刊
东北黑土区属"雨养农业",水分是该地区农业生产中的主要限制因子。施肥管理通过影响土壤理化性质和作物生长调控土壤水分。以中国科学院海伦农田生态系统野外科学观测研究站内的水分平衡观测场为研究对象,基于10年的观测数据,分析研究区域内长期的施肥管理对土壤水分垂直变化和季节性变化的影响。研究结果表明不同的施肥管理方式显著影响了0~90 cm土层的土壤水分含量,表现为与无肥(CK)相比,化肥(NP)和有机肥
期刊
本文针对ASD-POCS算法中约束项权重对不同应用的多变性引起的算法鲁棒性差等问题,提出了一种基于稀疏约束的自适应正则化迭代重建算法,该算法采用一种Lagendijk型的正则化策略构造最优化问题,分别采用局部方差、图像能量估计自适应地求取加权对角矩阵和全局正则化参数。最优化问题的求解过程中,采用SART算法和共轭梯度法求解保真项和约束项最优化问题。实验结果表明,AR-SART-CG算法能更好地权衡
期刊
针对心内复杂结构,本文结合三维虚拟内窥镜技术和二维常规观测截面功能,开发了双源CT心脏图像的显示系统。用户可以在本系统内以自动和交互式的两种方式观测心内结构。自动方式,对造影剂增强的数据部分进行基于欧式距离的三维骨架化得到规划路径,光线投射法根据已算出的欧式跳过空白区域,减少了绘制计算量;交互方式,用户可以随时从内窥镜视角切换到当前视点所在的任意截面,便于进行二维和三维的结构和病理综合分析。而且,
期刊
4DCT图像应用于肿瘤的放线治疗中,能够在全呼吸周期中定位肿瘤的运动,同时有效地减少运动伪影的产生。目前,4DCT在临床应用中需要依靠外部呼吸信号检测装置提供呼吸信号运动信息。本文提出了一种4DCT自动图像排序算法,不需要外部呼吸监测装置,在Cine扫描模式下采集图像数据,从第一个床位开始,利用空间连续性特征,寻找相邻床位之间呼吸相位相同的图像,将其归入相应的图像集合中,以此类推,直到全部床位的图
期刊
"2012年全国射线数字成像与CT新技术研讨会"于2012年7月10~11日在四川省绵阳市举行。来自全国相关学科领域的科技工作者约70人到会参加了学术交流活动。会议由中国体视学学会CT理论与应用分会主办,国家X射线数字化成像仪器中心、中国工
期刊
自从几十年前豪斯菲尔德因其突破性工作而赢得诺贝尔奖以来,X线CT已经被广泛的应用到了临床前以及临床应用,并产生了海量的灰度断层图像。由于其固有的光子计数问题涉及到较高的辐射剂量,这些灰度断层图像的软组织对比度差,经常难以提供一些关键性的细节而满足诊断的需要。从物理的角度来看,X线的谱是多能的,获得多能CT(亦被称为谱CT,真彩色CT)图像是可行的。这种谱图像提供了强有力的新诊断信息。近年来,新兴的
期刊
针对有限角度扫描的CT重建,提出一种基于模型融合的CT迭代重建方法。模型来源于患者的早期Dicom图像。对扫描角度有限的投影数据,用统计迭代算法进行初步重建,得到预重建图像;将预重建图像与模型进行融合,得到融合图像;然后再次投影,补全原始投影缺失的部分,根据补全的投影数据重建出中间结果,之后重复投影、融合、重建过程直到满足终止条件。仿真实验表明,该算法能完整重建整个目标,在有效保留原目标特征的同时
期刊
目前多层CT的重建算法主要有基于FDK的三维滤波反投影算法以及基于多层投影数据重排的二维FBP重建算法。本文对传统的FDK算法、基于投影角度二维/三维加权的CB-FBP算法以及自适应轴向插值AAI-FBP算法的性能进行了对比实验,并对实验数据进行了细致地分析。实验结果表明:在这几种重建算法中,AAI-FBP算法对于多层CT的重建效果最好,这对于后续多层CT重建算法的改进以及临床应用研究提供了可靠的
期刊
图像分割是图像处理中至关重要的一步,是进行图像分析与图像理解的基础,分割效果的好坏直接关系到后续的图像处理。针对目前主动轮廓模型在图像分割领域中分割速度慢的缺点,提出了一种新的初始轮廓设置方法。首先将图像进行预处理得到一个或几个较粗糙的连续轮廓;然后利用八邻域分割法,检测出该边缘作为梯度矢量流主动轮廓模型的初始轮廓,经过迭代后得到较精确的收敛轮廓。大量医学图像分割实验表明,运用本文提出的方法能够较
期刊