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DNA数据库比对技术实质上是基因检测技术和大数据处理技术相结合的产物.DNA数据库比对技术可以精确锁定犯罪嫌疑人,由于其强大的证明能力而被广泛地运用于刑事侦查,各国都积极推动DNA数据库的建立.DNA数据库比对技术在维护了社会安全的同时也对公民基因隐私构成极大威胁.如何在技术的运用和隐私权保障之间做出更好的平衡,是DNA比对技术的合宪性争议的中心.廓清了合宪性问题,我们才可以更好地制定相关法律,消弭合宪性问题,在保障公民隐私权的同时也更好地维护社会安全.