【摘 要】
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本研究运用转录组测序技术比较分析了象耳豆根结线虫侵染番茄根系的基因表达情况,旨在深入挖掘象耳豆根结线虫的致病相关基因.对番茄根系侵染前后的转录组数据进行差异表达分
【机 构】
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云南农业大学植物保护学院,昆明,650201
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本研究运用转录组测序技术比较分析了象耳豆根结线虫侵染番茄根系的基因表达情况,旨在深入挖掘象耳豆根结线虫的致病相关基因.对番茄根系侵染前后的转录组数据进行差异表达分析,共筛选到7 138个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中有375个上调基因,9 763个下调基因.对差异表达基因进行功能、代谢以及调控途径分析,从整体上掌握了象耳豆根结线虫侵染前后差异基因的表达模式.结果 表明当象耳豆根结线虫侵染寄主根系以后,其细胞组分、分子功能和生物代谢过程都有明显的变化.象耳豆根结线虫侵染寄主根系以后,有大量的基因发生差异表达,其中涉及到了胞外间隙,水解酶活性,转录翻译后的修饰、焦点黏连代谢途径和蛋白质在内质网上加工代谢途径等.通过qRT-PCR验证了上调基因的表达趋势与测序分析结果的一致,证明了测序结果的准确性.上述分析为进一步揭示象耳豆根结线虫的致病机理提供了有价值的参考.
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