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复杂重大科技工程在多种力量的共同努力下取得了显著的成效,但是同时又存在资源消耗过大、沟通困难和创新效率受限等问题,严重制约了复杂重大科技工程的发展.鉴于以上问题,需要构建协同创新联盟管理机制,为各个系统提供沟通的便利,同时还对资源的整合利用具有重要意义.文中就以载人航天工程的协同创新联盟管理为例,对复杂重大科技工程的协同创新联盟管理机制进行简要分析.