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目的：探索适用于肝癌大规模基因组扫描的自动化微卫星不稳定性基因分型实验方法．方法：应用6对高度多态性微卫星标记物对56例肝细胞癌基因组进行PCR扩增，产物通过MegaBACE500毛细管电泳测序仪进行电泳，采用Genetic Profiler软件进行基因分型，摸索不同PCR条件以及PCR体系残留混合物对分型结果的影响．结果：通过1次PCR和电泳能得到48个样品的分型结果，常见的等位基因表型包括杂合子、纯合子、杂合子丢失、微卫星不稳定性和等位基因失衡等几种模式，其中微卫星不稳定性基因表型呈多种特征；MSI的