【摘 要】
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目的筛选新型冠状病毒肺炎(COVID-19)症状相关的核心基因及信号通路,进而分析潜在的靶向药物。方法从文本挖掘数据库中获取与COVID-19主要症状相关的7个基因列表,取交集得到新的基因集。R软件进行基因功能注释和通路富集分析,Cytoscape软件可视化STRING数据库中的蛋白互作网络信息,并按分值筛选出核心基因,再通过DGIDB数据库分析基因与药物之间的作用关系,确定潜在的靶向药物。结果通过文本挖掘到97个与COVID-19症状相关的基因,其涉及的生物学过程主要为:Stat5蛋白酪氨酸磷酸化的正调
【机 构】
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广东医科大学公共卫生学院,广东医科大学公共卫生学院,深圳市疾病预防控制中心
【基金项目】
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深圳市科技创新委基础研究(No.JCYJ20180508152244835),深圳市医学重点学科建设基金(No.SZXK064)。
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目的筛选新型冠状病毒肺炎(COVID-19)症状相关的核心基因及信号通路,进而分析潜在的靶向药物。方法从文本挖掘数据库中获取与COVID-19主要症状相关的7个基因列表,取交集得到新的基因集。R软件进行基因功能注释和通路富集分析,Cytoscape软件可视化STRING数据库中的蛋白互作网络信息,并按分值筛选出核心基因,再通过DGIDB数据库分析基因与药物之间的作用关系,确定潜在的靶向药物。结果通过文本挖掘到97个与COVID-19症状相关的基因,其涉及的生物学过程主要为:Stat5蛋白酪氨酸磷酸化的正调
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