在铬、铜和镍复合污染的3段波形潜流人工湿地中采集0~15 cm土壤样品,分别以单氨加氧酶的编码基因amoA和亚硝酸还原酶的编码基因nirK的部分序列作为硝化细菌和反硝化细菌的指示基因,采用实时聚合酶链式反应(实时PCR)与PCR–变性梯度凝胶电泳(PCR–DGGE)结合克隆和测序的方法,研究了硝化细菌与反硝化细菌群落结构的空间分布。结果表明,在人工湿地中,amoA和nirK基因丰度均在第3段最高,分别为(8.60±2.75)×106拷贝·g–1和(137.76±42.16)×106拷贝·g–1。回收的15个amoA基因序列中有7个属于簇3a,而8个nirK基因序列中有3个属于簇III。相关性分析表明,amoA基因拷贝数与全量铜、全量镍和铬的活化率呈显著负相关(r分别为-0.870、-0.884和-0.898),但有效铜与amoA香农-维纳指数和辛普森指数之间均呈显著正相关(r分别为0.892和0.940),铜的活化率与amoA基因均匀度呈显著正相关(r=0.887);nirK基因拷贝数与全量铜、全量镍和铬的活化率也均呈显著负相关(r分别为-0.818、-0.820和-0.860),但有效铜与nirK基因均匀度呈显著正相关(r=0.917)。以上结果表明,硝化细菌和反硝化细菌在人工湿地各个阶段的变化规律基本相同,这二者的丰度与多样性指数对重金属污染的反应总体上呈相反的变化。