目的探讨卫气虚证胸腺代谢组学的特征性代谢标志物及玉屏风散的干预作用。方法将30只SD大鼠随机分为正常组、模型组和治疗组,每组10只。正常组常规饲养,模型组给予疲劳联合寒热交替法复制大鼠卫气虚证模型,治疗组每日造模后灌服玉屏风散中药配方颗粒剂25 g/(kg·d),连续7天。采用高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪(HPLC-MS)检测各组大鼠的胸腺代谢物,利用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)对检测数据进行统计分析,比较各组大鼠胸腺代谢组学原始谱图和数据,确定潜在标志物及其变化趋势。结果皮质醇、环腺苷酸、硫胺、棕榈酸、高肌肽、天门冬氨酰苏氨酸、富马酸二甲酯、腺嘌呤8种差异代谢物为正常组区分模型组的可能标记物,其中棕榈酸在模型组呈上升趋势,其余物质在模型组呈下降趋势;治疗组的这8种差异代谢物向正常组回归,棕榈酸在治疗组显著回落,其余物质显著回升。结论皮质醇、环腺苷酸、硫胺、棕榈酸、高肌肽、天门冬氨酰苏氨酸、富马酸二甲酯、腺嘌呤共同构成了卫气虚证大鼠的胸腺代谢组学特征性标志物,而玉屏风散具有回调以上物质在胸腺内紊乱代谢的作用。