[目的]应用Citespace可视化软件对国内蛋白质组学发展及前沿热点进行知识图谱分析.[方法]利用Citespace文献计量绘图软件检索中国知网(CNKI)数据库,采用高级检索选项,依条件依次输入主题词,对1992～2020年间国内文献的核心作者、机构群间的合作、关键词前沿热点网络图谱进行分析.[结果]依条件筛选后,纳入中文文献3 626篇,蛋白质组学年发文量经过2008年高峰期后进入相对稳定期,发文量保持约150篇;研究机构涉及261家,机构间相互合作212项,主要集中在各大医学高校;分子技术中的双向电泳(#3)、Itraq(#4)、质谱(#4)和组学中的代谢学(#6)、差异蛋白(#6)和生物信息学(#7)成为研究热点;代谢组学、转基因组学、Itraq、差异蛋白和生物标志物为代表的新型突现词将成为该领域研究的新趋势.[结论]蛋白质组学应用偏向基础研究领域;机构和团队之间缺乏合作,大都集中在机构内部的合作;根据新型突发词预测代谢组学、转基因组学、Itraq、差异蛋白和生物标志物等方面将成为未来研究的热点.