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不同的植物启动子使植物基因具有不同的表达特性，按其作用方式大体可以分为3类，即组成型启动子、诱导型启动子和组织特异性启动子。另外还有两类较为特殊的启动子——双向启动子和可变启动子。在这些启动子中，除了舍有基本启动子外，还存在一些特异的顺式调节元件，这些顺式调节元件在基因的特异表达中发挥重要作用。不同类型的启动子在植物基因工程中得到广泛的应用。