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为了探明黑线仓鼠MHC的结构与功能并寻找分子标记，对MHCⅡ类DQA基因的外显子2进行克隆和序列分析．提取黑线仓鼠3个群体（吴村、沂南和临朐）的基因组DNA构建基因池，利用PCR技术扩增得到249bp的片段，将该目的片段连接到pMD18-T载体中，重组质粒转入大肠杆菌DH5α后利用蓝白斑法筛选阳性克隆，测序后得到该目的片段的核苷酸序列（Genbank登录号：FJ209306）并推导出氨基酸序列．结果表明：黑线仓鼠、人类、大鼠、小鼠、猪、马、牛、兔之间DQA基因外显子2的核苷酸序列同源性为68．7％-85％