目的了解急性脑炎、脑膜炎的主要细菌和真菌性致病病原及其发病情况、临床特征,为临床诊治和防制策略的制定提供依据。方法在广西壮族自治区贵港市12所县级及以上医院建立覆盖全人群的急性脑炎、脑膜炎症候群监测系统,制定统一的监测病例定义标准,对符合监测病例定义的病例进行流行病学个案调查,采集血液和(或)脑脊液标本进行细菌学培养和聚合酶链反应(PCR)检测,用χ2检验或Kruskal-Wallis秩和检验对不同类型病原病例的临床特征和生化检测结果进行比较分析。结果 2007年5月至2012年6月,贵港市共监测到急性脑炎、脑膜炎病例2382例;检出细菌和真菌性病原38种104例病例,估算的细菌和真菌性脑炎、脑膜炎年均发病率为0.6/10万,其中链球菌属、新型隐球菌和葡萄球菌属是其主要病原。细菌和真菌感染病例大多数基本特征和临床表现类似,均为男性多于女性,真菌感染以成年人多见,细菌性感染多见于儿童且临床症状更严重,意识障碍和抽搐较为多见。结论引起急性脑炎、脑膜炎的细菌种类多样,由于不同细菌对各类抗生素的敏感性不同,真菌感染应进行特异性的抗真菌治疗,建议医疗机构加强实验室病原学检测。