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推进主体功能区规划建设时要选择适当的区域政策工具。在实际运用时，一些区域政策工具可能会产生矛盾的效应，特别是在区域政策资源为多个部门所掌握时，矛盾和冲突是不可避免的，因此，运用基金工具对区域政策工具进行协调是必要的。本文从区域政策工具选择入手，探讨了运用基金工具协调区域政策工具的必要性、可行性与运行模式，并且提出了相应的政策建议。