新城疫病毒(青岛株)F蛋白基因的克隆和序列分析

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参考新城疫病毒(NDV)长春株的F基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR对NDV青岛株(野毒)的F基因进行了扩增,扩增产物克隆后测序。扩出的F基因核苷酸长度为792 bp,编码261个氨基酸,包括完整的F2片段和部分F1片段。裂解位点区(112~117 aa)氨基酸序列为Arg-Arg-Gln-Arg-Arg-Phe,与国外发表的强毒株序列相符,证明青岛株为强毒株。根据该基因推导的氨基酸序列,与国内外发表的NDV F蛋白氨基酸序列相比,同源性为88.1%~94.3%。
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