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目的 对我国登革2型病毒04株(D2-04)基因组进行全序测定及分析,为了解其基因组结构与生物功能的关系及研究开发登革病毒新型疫苗奠定基础.方法 根据登革2型国际标准株NGC的序列,设计13对重叠引物,通过RT-PCR扩增出D2-04株不同的cDNA片段,分别克隆到pGEM-T载体,转化受体菌DH5α,挑取阳性克隆进行PCR、酶切鉴定及序列测定.结果 D2-04株的基因组全长10723个碱基,从97到10269位为一个长的开放读码框,编码3391个氨基酸.将它与其它登革2型病毒株NGC、JAM、PR159 (S1)、16681及它的候选疫苗株PDK-53进行比较,其核酸序列同源性分别为95.0%、 97.6%、 89.8%、 93.8%和 93.7%,氨基酸序列的类似性分别为97.8%、 98.6%、 96.7%、 97.6% 和 97.5%.结论 我国D2-04株的基因组全序列基本类似于已发表的其它登革2型病毒株.在比较的5株登革2型病毒株中,D2-04株更类似于JAM株,其次是NGC株,与S1株的类似性略低.比较的结果表明,D2-04株与JAM株紧密相关,它们可能属于同一拓扑型.D2-04株全序的测定,对分析我国毒株来源及研制适于我国人群的登革疫苗具有一定意义.