龙眼SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析

来源 :中国农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sven1989
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]鉴定龙眼SPL(D1SPL)基因家族所有成员,并对其成员进行表达分析,为探究SPL在龙眼生长发育中的功能研究提供参考.[方法]采用生物信息学方法对龙眼SPL基因家族成员进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件、FPKM值进行分析;利用qRT-PCR技术检测其在非胚性愈伤组织(nonembryonic callus,NEC)、胚性培养物及不同激素处理下的胚性愈伤组织(embryonic callus,EC)中的表达情况.[结果]D1SPL基因家族共有14个成员,其基因结构和蛋白结构均高度保守且只有一个SBP结构域,D1SPL启动子存在大量的光反应元件、组织特异性调控元件、激素应答元件、胁迫响应元件和植物生长发育有关的顺式调控元件.RNA-seq表达量分析(FPKM值)表明,11个D1SPL成员在不同光质处理的EC中表达,只有D1SPL8在蓝光和白光处理下的EC中呈下调表达趋势;11个D1SPL成员在激素2,4-D和KT中表达,其中D1SPL3和D1SPL13在2,4-D和激动素(kinetin,KT)共同处理下的表达量高于2,4-D和KT分开处理;有13个D1SPL成员在非胚性及胚性培养物中表达,其中7个成员在NEC阶段表达量最高.qRT-PCR结果表明,在不同胚性培养物中,D1SPL1和D1SPL14在EC阶段表达最高,D1SPL5、D1SPL7和D1SPL13在不完全胚性紧实结构(incomplete embryonic compact structure,ICpEC)阶段表达量最高;D1SPL1、D1SPL5、D1SPL7和D1SPL13成员响应脱落酸(abscisic acid,ABA)信号并显著下调;D1SPL5响应茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)信号且呈上调表达趋势,其他3个成员呈下调表达趋势.[结论]共鉴定出龙眼SPL基因家族成员14个,均含有一个高度保守的SBP结构域;D1SPL可能参与龙眼体胚的形态建成,并响应ABA和MeJA的应答.
其他文献
期刊
期刊
[目的]通过不同施钾水平对纽荷尔脐橙树体养分吸收、产量和品质的影响研究,提出纽荷尔脐橙适宜施钾量,为纽荷尔脐橙钾肥的科学合理施用提供理论依据.[方法]以7年生枳(壳)砧纽
自1954年硅材料压阻效应被首次发现以来,这一领域的理论和实验研究不断出现,并且基于此效应的各种硅基压敏传感器和加速器被广泛应用。随着电子集成电路尺寸不断减小,以及低维半导体纳米材料的发现,人们发现纳米材料相比于体材料可以承载更大的弹性应变,并且具有很多奇特性能。因此,深入理解硅材料尺寸下降到纳米尺度时,其压阻效应的变化规律对应变调控半导体材料性能研究以及基于硅压阻效应的微纳器件设计具有重要意义。