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经克隆测序获得了采自长江口九段沙、钱塘江口、舟山等3个地点35尾刀鲚（Coilia nasus）的mtDNA控制区全序列,分析了控制区序列的变异和遗传结构。结果显示,长江口邻近水域刀鲚的mtDNA控制区序列具有长度多态性,全长为1214-1291bp,主要是在第358位点处有以“CTA TGT ATT ATA TTA CAT ATA TTA TGG TAT AGT ACA TA”38bp为单位的1-2次片段重复。种群遗传结构分析显示,长江口邻近水域刀鲚的平均单倍型多样性（h）为0.9983,3个群体的平均