独行菜抗逆相关转录因子LaDREB密码子偏性与进化分析

来源 :江西农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liweimin90
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【目的】为明确独行菜抗逆相关转录因子LaDREB基因密码子的使用特性。【方法】运用CodonW与EMBOSS程序及Excel、SPSS、MEGA等软件,分析了独行菜与其他物种中抗逆相关转录因子DREB基因的密码子使用偏好性,比较了独行菜LaDREB基因与模式生物的密码子使用频率。【结果】独行菜LaDREB基因的ENc(有效密码子数)、CAI(密码子适应指数)和GC含量分别为50.49、0.261和45.60%,表明其密码子使用偏性较弱,密码子偏好使用AT结尾;根据RSCU值,确定独行菜LaDREB基因高频
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