HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异相关性初步研究

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目的 分析我国HIV 1流行株的生物学表型及其与V3环序列变异的相关性。方法 采用传统的共培养方法从HIV 1感染者新鲜外周血单个核细胞 (PBMC)中分离病毒并在MT 2细胞上测定分离株的融合诱导性 ,用表达CD4和趋化因子受体CCR5或CXCR4的GHOST( 3)测定毒株的辅助受体利用情况 ,用巢式 聚合酶链反应 (nest PCR)扩增V3环及两侧区序列并对其序列进行测定 ,用GCG软件分析氨基酸序列。结果 在所分析的 5个原代毒株中 ,LTG0 2 13和LTG0 2 14为合胞体诱导型 (SI) ,利用CXCR4辅助受体 ;XJN0 0 2 1、XJN0 0 91和SHXDC0 0 4 1为非合胞体诱导型 (NSI) ,利用CCR5辅助受体。X4 /SI病毒和R5 /NSI病毒在V3环氨基酸序列方面 ,存在明显的区别。CCR5表型中国株第 8、11、18及第 2 5位氨基酸的共同基序为 :8 TXXS/GXXXXXXR/QXXXXXXE/D 2 5 ,CXCR4表型株在这些位置出现碱性氨基酸取代 (第 2 5位除外 ) ,引进正电荷。结论 HIV 1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异密切相关 ,V3环上第 8、11、18及第 2 5位积累碱性氨基酸 (或由酸性氨基酸转变为中性氨基酸 ) ,可以使病毒由NSI/R5表型转变为SI/X4表型 ,可以根据V3环氨基酸序列预测病毒的生物学表型
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