【摘 要】
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为了解榆叶梅(Prumus triloba Lindl.)在短期碱胁迫下的分子响应机制,本研究采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术对其在0、1、3、6、12 h碱胁迫下的叶片进行了de novo转
【机 构】
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四川省农业科学院园艺研究所,农业农村部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
【基金项目】
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四川省财政创新能力提升工程专项资金项目(2019),科技成果中试熟化与示范转化工程项目(2019),四川省科技扶贫专项(2017NFP0031)
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为了解榆叶梅(Prumus triloba Lindl.)在短期碱胁迫下的分子响应机制,本研究采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术对其在0、1、3、6、12 h碱胁迫下的叶片进行了de novo转录组测序,以此鉴定与碱胁迫相关的差异表达基因(DEGs)。结果表明,从5 960万条raw reads中获得了约5 300万条高质量clean reads,经从头组装后获得了124 786条榆叶梅unigenes。基于8 948个unigenes差异表达(DEGs), GO富集分析发现,其中
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