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以准噶尔盆地21条典型的地震剖面上的329个取数据点资料为基础，应用EBM盆地模拟系统，对侏罗系西山窑组地层进行了沉降史回剥分析。从回剥的结果来看，盆地的沉降速率在不同时期显示出显著的不均一变化，其中在西山窑二段地层沉积时期的沉降速率在盆地南缘平均为70～90m／Ma，北缘及腹部地区只有30m／Ma左右；在西山窑一段地层沉积时期，盆地南缘的沉降速率则达到了120m／Ma，北缘及腹部相比前一阶段则没有太大变化。由此可以确定玛湖凹陷、乌伦古坳陷和昌吉凹陷是盆地在西山窑组地层沉积时期的沉降中心，盆地南缘的昌吉凹