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隐孢子虫为人兽共患性原虫，呈世界性分布，经水源和食物源途径传播，为人腹泻性疾病的一个重要致病因素。共有7个种（Cryptosporidium hominis，C．parvum，C.meleagridis，C．felis，C．Canis，C．muris，C．suis，C．andersoni，C．baileyi）以及一个基因型（cervine genotype，skunk genotype）可以感染人类。而目前尚无有效的治疗性药物，因此研究隐孢子虫具有公共卫生重要性。