基于网络药理探讨四妙散治疗骨性关节炎的作用机制

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  摘要 目的:基于網络药理学探讨四妙散治疗骨性关节炎(OA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,通过Uniprot数据库进行靶点预测;通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库获取OA的相关靶标,并进一步对药物和疾病靶点相映射得到四妙散治疗OA的潜在靶点,运用Cytoscape和STRING软件构建“中药-成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选可能发挥治疗作用的重要成分及靶点,并对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。结果:从四妙散中共筛选出活性成分67个,包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、汉黄芩素、非洲防己碱等,与骨关节炎相关的作用靶点524个,包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。四妙散主要通过调节TNF信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究运用网络药理学预测了四妙散治疗OA可能的活性成分、关键靶点及作用通路,体现了中药治疗疾病具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。
  关键词 四妙散;骨性关节炎;活性成分;靶点;网络药理学;作用机制
  Abstract Objective:To explore the mechanism of Simiao Powder in the treatment of osteoarthritis based on network pharmacology.Methods:The active components of Phellodendron Phellodendri,Atractylodes,Coix seed and Achyranthes bidentata in Simiao Powder were retrieved from TCMSP database,screened under the condition of OB≥30%,DL≥0.18,and the target was predicted by Uniprot database.The related targets of osteoarthritis were obtained through the databases of TTD,Drugbank,CTD,Gencards,OMIM,PharmGKB,GAD and KEGG,and the important targets of Simiao Powder in the treatment of osteoarthritis were further mapped by drugs and disease targets.The PPI network of “traditional Chinese medicine-active ingredient-important target” and protein interaction was constructed with Cytoscape and STRING,and the main treating components and key targets were screened.The potential action mechanism of the targets was obtained by GO functional enrichment and KEGG pathway enrichment analysis.Results:A total of 67 active components were screened from Simiao Powder,including quercetin,stigmasterol,β-sitosterol,wogonin,Tetrandrine,etc,and 524 targets related to osteoarthritis,including TNF,IL6,MAPK1,PTGS2,MAPK8 and so on.Simiao Powder mainly played a role in the treatment of osteoarthritis by regulating signal pathways of TNF,HIF-1,NOD-like receptor,Toll-like receptor.Conclusion:In this study,the possible active components,key targets and pathways of Simiao Powder in the treatment of osteoarthritis were predicted by the method of network pharmacology,which reflects the characteristics of “multi-components,multi-targets and multi-pathways” in the treatment of traditional Chinese medicine.It provides a theoretical foundation for the study of its pharmacodynamic material base and functional mechanism.
  Keywords Simiao Powder; Osteoarthritis; Active ingredient; Target; Network Pharmacology; Mechanism of Action   中图分类号:R289.4;R285文献标识码:Adoi:10.3969/j.issn.1673-7202.2021.18.006
  骨性关节炎(Osteoarthritis,OA)是一种退行性关节疾病,可逐渐影响关节功能。以关节软骨和软骨下骨重建的退行性丢失和异常修复为特征,可以致残,并极大地影响个人生命质量[1]。世界卫生组织(WHO)估计,在60岁及以上的老年群体中,约10%的男性和18%的女性有OA症状,其中80%有活动障碍表现[2]。据预测,到2050年,60岁以上的人口将显著增加,在全球范围内达到20多亿,老年人口的增长将导致全球OA发病率的增加[3]。OA的发生是一个复杂的过程,涉及许多危险因素,如年龄、性别、职业、种族、肥胖、遗传、创伤、炎症、饮食、激素等[4-5]。骨关节炎在临床中常常表现为关节僵硬和间歇性疼痛的轻微症状,关节活动受限和持续剧烈疼痛的严重症状,以及关节不稳定和跛行等更为严重的症状[6]。现代医学治疗早、中期OA多选用氨基葡萄糖、非甾体抗炎药等药物,但常引起上消化道出血及肝肾损害等不良反应[7],晚期严重者需行关节镜和手术治疗。近年来,中医药对于OA的治疗有较好的疗效,特别是在OA的早、中期,中医药治疗具有明显优势。中医古籍中无“骨性关节炎”一词,但根据其症状及其表现可归属中医学“痹证”“骨痹”范畴。
  四妙散出自清代张秉成的《成方便读》一书,该方由黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝组成,具有清热利湿、补益肝肾的功效。方中黄柏性味苦寒,善清下焦湿热,苍术燥湿健脾,薏苡仁祛湿热,利筋络,牛膝补肝肾强筋骨,还可加强诸药走入下焦之力。其组方全面严谨,功专效宏,是作为临床治疗湿热痹症的常用方。吴鹏飞[8]研究结果证实四妙散加减能够显著改善膝关节OA患者的临床症状,提高治疗有效率。梅宗志[9]运用四妙散加味治疗观察组膝关节OA患者的有效率高达90.32%,明显改善膝关节的疼痛及活动程度。钟邱等[10]运用四妙散加味联合针灸推拿治疗膝关节OA,疗效显著。
  中医药治疗骨关节炎的方法在临床上应用较广泛,且取得了较好的疗效,但中医药临床辨证施治和各种治疗方式的应用与普及,一直缺乏可被接受的科研规范,阻碍中医药疗法成为治疗骨关节炎的主流治疗方法[11]。目前,网络药理学作为一门新兴交叉学科。它构建了“药物-靶向-疾病”的多层网络,利用网络分析观察药物对疾病网络的干预和影响,从而更好地理解药物对疾病的治疗作用[12]。其强调从“一个目标,一种药物”向“网络目标,多组分治疗”的范式转变,具有整体性和系统性特点。而这与中医药的整体思维及中医辨证论治的整体思想相一致[13-15]。基于此,本研究通过网络药理学挖掘分析四妙散治疗OA的活性成分及作用靶点,并为其作用机制提供依据。
  1 资料与方法
  1.1 软件与数据库 分析软件使用Cytoscape 3.7.2,所用数据库名称及其网址见表1[16-26]。
  1.2 药活性成分及药物靶点的筛选 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),分别输入黄柏、苍术、牛膝、薏苡仁4味中药的名称,搜索获取活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,汇总活性成分,并检索对应的靶标蛋白。利用Uniprot数据库(https://www.uniprot.org/)查询靶标蛋白所对应的基因名称,对重复的靶点进行删除,加以汇总。
  1.3 疾病相关靶点的检索 通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库分别以疾病名称“Osteoarthritis”进行检索,根据不同的筛选条件总结归纳,进而得到OA的相关靶点。将中药活性成分的作用靶点与OA疾病靶点交互映射,以获取潜在靶点。
  1.4 中药-活性成分-靶点网络图的构建 将四妙散4味中药的名称、主要活性成分及其靶点的相关数据导入至Cytoscape 3.7.2软件以绘制中药-活性成分-靶点网络图。
  1.5 建潜在靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络 将四妙散作用于OA的潜在靶点导入STRING数据库,设置蛋白质种类为“homo sapiens”,其他参数默认,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络模型,其中自由度(Degree)表示与该节点直接连接的节点数目。利用Cytoscape 3.7.2进行网絡拓扑属性分析,以筛选出四妙散治疗OA的关键靶点。在STRING数据库中导入33个潜在靶点以绘制PPI网络图。图中圆点代表靶点,若颜色越深,形状越大,则代表该节点与其他节点之间的连线越多,关系越密切。
  1.6 基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析 DAVID数据库作为一种基因注释工具,可充分发掘基因与疾病间的相关性,并对相关基因进行富集分析[26]。利用该数据库对四妙散治疗OA的潜在靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,找出其关键通路。
  2 结果
  2.1 中药活性成分及药物靶点的筛选结果 共检索到四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分分别为140、49、38、176个,以OB≥30%,DL≥0.18为筛选条件,共获取活性成分67个,其中黄柏38个,苍术9个,薏苡仁9个,牛膝21个。靶点预测发现,黄柏736个、苍术68个、薏苡仁87个、牛膝444个,去除重复靶点后共获得84个。
  2.2 OA相关靶点检索结果 通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库分别检索到10、14、384、76、65、1、63、2个靶点,合并及删除重复靶点后共获得524个重要靶点。   2.3 中药-活性成分-靶点网络构建结果 将四妙散活性成分靶点与OA靶点进行映射,获得四妙散治疗OA的33个潜在靶点,以韦恩图的形式展示。见图1。通过Cytoscape 3.7.2软件构建中药-活性成分-靶点网络图,从中可见该网络共有155个节点,包括4个药物、67个活性成分及84个靶点节点,共有1 384条边。Degree值前10位的活性成分主要有MOL000098(槲皮素)、MOL000449(豆甾醇)、MOL000358(β-谷甾醇)、MOL000173(汉黄芩素)、MOL000785(非洲防己碱)等。见表2。此外,每个活性成分平均与20.66个靶点互相作用,而每个靶点平均与15.56个活性成分互相作用。见图2。
  2.4 潜在靶点PPI网络的构建结果 共有33个节点,274条边,Degree均值为16.61,其中大于Degree均值的靶点共有15个。见图3。网络中的10个关键节点可能在四妙散治疗OA中发挥着关键作用。见图4。
  2.5 GO功能富集及KEGG信号通路富集分析结果 共得到211条GO富集条目(P<0.05),其中包括153个生物过程(Biological Processes,BP)、20类细胞组分(Cell Components,CC)和38种细胞功能(Molecular Function,MF)。BP主要富集在RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、信号转导、转录调控、凋亡过程、基因表达等;CC方面,在胞质核周区、线粒体、核质、胞外区、质膜基因富集占比较高;MF方面主要富集在血红素结合、类固醇激素受体活性、蛋白质同二聚体活性、序列特异性DNA结合、转录活性等。见图5。
  共富集到与OA相关的KEGG信号通路79条,其中P<0.05的信号通路共有70条。其中主要显著在癌症途径、TNF信号通路、恰加斯病、甲型流感、利什曼病、百日咳、沙门菌感染、破骨细胞分化、类风湿性关节炎通路、HIF-1信号通路、NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路等。KEGG通路富集前20位(按P值排列)。见图6。气泡图Y轴英文字母代表KEGG通路名称,X轴数字代表基因的百分比,圆圈大小代表富集的基因个数,颜色代表-Log10 P值,其与富集的程度正相关。
  3 讨论
  OA是一种以关节软骨退化、骨赘形成、滑膜增生、软骨下骨囊肿和硬化为特征的退行性关节疾病,是导致老年人群关节疼痛和功能障碍的主要原因之一[27]。流行病学研究表明,55岁和65岁患者的OA发病率分别为44%~70%和60%~70%[28]。尽管OA的患病率很高,但其发病机制仍不明确。OA在中医古籍中未提及,但根据其症状及表现,将其归于中医“痹证”“骨痹”的范畴。中医认为人至中年,肝肾亏虚,筋骨肌肉渐失濡养,寒湿之邪易乘虚而入,滞于筋脉关节,引起关节肿痛,寒湿日久郁而化热,进而形成湿热痹证。故肝肾亏虚是痹证的基本病机,清热利湿更应首当其冲,补益肝肾亦不可加重湿热,因此当以清热利湿为主兼顾补益肝肾[10]。而四妙散可清热利湿,补益肝肾,是临床治疗湿热痹症常用方,已广泛应用证属湿热痹症的关节疾病。
  本研究初步筛选出四妙散中67个重要活性成分,检索到四妙散治疗骨关节炎84个重要靶点,绘制出中药-活性成分-靶点网络图,结果显示节点度值较高的活性成分主要有槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等。其中槲皮素是一种天然黄酮类化合物,在抑制炎症介质生成、影响炎症相关信号通路以及抑制ECM降解等方面起到保护关节软骨的作用,以延缓OA的发展[29]。豆甾醇、β-谷甾醇皆属于植物甾醇,Chen等[30]研究发现豆甾醇在抑制基质金属蛋白酶表达方面具有重要作用,能减少软骨的降解,具备治疗OA的潜力。Choi等[31]研究发现β-谷甾醇可明显抑制NO的合成,减弱巨噬细胞IL-6的活性,从而减少TNF、IL-1等炎症介质的分泌而发挥其抗炎作用。四妙散治疗OA的PPI网络图显示共有33个靶点蛋白,通过网络拓扑分析得到的关键靶点包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。有研究证实TNF在关节滑膜炎性病变及软骨基质的降解过程中起重要作用[32]。IL6作为炎症介质,通过促进细胞外基质更新的速度,进而加快关节软骨细胞退化和凋亡[33]。MAPK1、MAPK8同属于丝裂原活化蛋白激酶家族,有研究表明MAPK途径是介导OA软骨损伤极为重要的信号转导系统,其主要机制是利用关节炎的特异性炎症介质、生长因子等与细胞膜受体结合,以激活细胞内MAPKs信号通路,引起相关反应,例如MMPs表达增加、软骨细胞凋亡、软骨破坏等[34]。PTGS2是一种较为典型的炎症反应基因,在OA的发病机制中具有一定作用,有研究发现抑制T型VGCCs可通过降低PTGS2的表达来减弱软骨细胞的OA样表型[35]。
  GO富集分析结果表明,四妙散治疗OA主要通过转录调控、细胞凋亡、信号转导,基因表达等生物过程实现的。KEGG信号通路结果显示,四妙散主要通过干预炎症反应、细胞周期、破骨细胞分化等通路治疗OA。与炎症相关的通路主要是TNF信号通路及NOD样受体信号通路。TNF是一种细胞因子,可与细胞膜上特异性受体结合,从而发挥促进细胞生长、分化、凋亡及诱发炎症的作用[36]。有研究发现TNF-α可通过促进滑膜炎症和激活软骨细胞及滑膜成纤维细胞参与OA的发病机制[37]。在NOD样受体信号通路中,NOD样受体作为一种模式识别受体,在自身免疫反应起始阶段发挥重要作用,在受到刺激后活化,通过激活Caspase-1蛋白促进细胞的死亡以及炎症反应,从而进一步激活MAPK途径,影响软骨细胞内基因的转录及修饰,最终导致关节基质的降解和关节炎症[38]。干预细胞周期相关的HIF-1通路,在骨发育、再生与成骨结合过程中起着至关重要的作用,可介导软骨细胞对缺氧的反应,促进细胞外基质合成和抑制凋亡,在软骨内稳中起关键作用[39]。Toll样受体(TLRs)是一類天然免疫受体,在软骨细胞中可表达,其中TLR4是最主要受体,在OA的进展中具有重要作用[40],钱臣和卞晓星[41]发现TLR4的表达活化与软骨细胞的凋亡有密切联系。此外,其他显著性较高的通路,如癌症通路、美洲锥虫病等通路也可能成为四妙散治疗OA的重要通路,但相关文献较少,仍待进一步探索,可能成为今后研究的重点。   本研究为开展四妙散的临床应用和科学研究提供了重要参考,证明了四妙散中多种成分可以作用于同一靶点,一种成分同样可以通过不同靶点起作用,充分体现了四妙散治疗OA具有“多成分、多靶点、多通路”的特点。但是四妙散成分多样、作用机制复杂,本研究仅通过数据库的检索来分析四妙散治疗OA的活性成分及可能作用机制,尚未进行进一步的实验验证,具有一定局限性,而后仍需大量的临床及实验研究证实。
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  (2020-10-18收稿 责任编辑:杨觉雄)
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[目的]分析夏枯草硫酸多糖对异烟肼所致小鼠抗结核药物性肝损伤的保护作用,并探究其可能的机制.[方法]将24只SPF级雄性C57 BL/6小鼠随机分为正常对照组、模型组和实验组,每组8只.模型组和实验组每日定时予以异烟肼100 mg/kg灌胃1次.实验组于异烟肼灌胃前予以夏枯草硫酸多糖100 mg/kg灌胃预处理,每4d灌胃1次,共3次.异烟肼处理2周后处死小鼠,检测血清丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)活性;肝脏匀浆后检测肝组织丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)活性;苏木精-伊红染色
[目的]探讨miR-431调控CaMK Ⅳ信号通路对新生大鼠坏死性小肠结肠炎(NEC)的影响.[方法]将新生SD雄性大鼠32只随机分为对照组、模型组、阴性对照组、miR-431 antagomir组,每组8只.通过苏木素-伊红(HE)染色对各组大鼠进行肠组织病理评分;酶联免疫吸附法(ELISA)检测各组IL-6、TNF-α表达水平;实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测各组miR-431、CaMK Ⅳ mRNA的表达水平;蛋白印迹(Western blot)检测各组CaMK Ⅳ蛋白及pCaM
[目的]探讨硫普罗宁联合糖皮质激素治疗放射性肠炎的作用.[方法]选择接受盆腔精确放疗的64例患者,随机分为实验组与对照组,实验组33例,对照组31例.实验组使用糖皮质激素联合硫普罗宁、对照组单纯使用糖皮质激素控制急性放射性肠炎症状,记录所有患者放疗前后一般状况、体质量、血象等指标;并跟踪随访1年左右时间,对比2组慢性放射性肠炎发生情况.[结果]实验组急性放射性肠炎控制率为90.90%,高于对照组的78.26%,但2组比较差异无统计学意义(P>0.05);实验组食欲下降、乏力不适发生率及重度中性粒细胞减少率
[目的]探讨美沙拉嗪辅助微生态制剂治疗老年(年龄≥65岁)溃疡性结肠炎患者的疗效及对其免疫功能、炎性因子的影响.[方法]选取入院就诊并确诊为溃疡性结肠炎的120例老年患者作为研究对象,采用随机数字表法将其分为观察组与对照组.对照组60例接受常规美沙拉嗪缓释颗粒治疗,观察组60例则在对照组治疗的基础上联合微生态制剂枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊治疗,比较2组的治疗效果及治疗前后免疫功能、炎性因子水平变化情况.[结果]观察组总有效率(95.00%)明显高于对照组(73.33%),2组比较差异有统计学意义(P<0.0
摘要 目的:建立芎附滴丸(XFDP)的质量标准,并对其进行抗偏头痛的药效学研究。方法:采用高效液相色谱法(HPLC)同时测定XFDP中8种主要成分的含量。评价XFDP对偏头痛大鼠5-羟色胺(5-HT)、β-内啡肽(β-EP)、降钙素基因相关肽(CGRP)、内皮素-1(ET-1)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、核因子κB(NF-κB)、一氧化氮合酶(NOS)含量,及Calca、c-fos mRN
摘要 目的:運用网络药理学及分子对接探究山药-陈皮治疗孤独症谱系障碍(ASD)的分子机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)并筛选山药-陈皮活性成分及靶点,检索Genecards、DisGenet、TTD数据库并筛选ASD疾病相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件建立山药-陈皮靶点基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络及ASD疾病基因PPI网络,提取Hithubs网
摘要 目的:系统评价连花清瘟制剂的临床用药安全。方法:在中国生物医学文献数据库(CBM)、中国期刊全文数据库(CJFD)、MEDLINE、EMbase中检索文献,检索时限设定为2005年1月至2020年7月,检索收录在上述数据库中与连花清瘟胶囊和连花清瘟颗粒随机对照临床试验相关的文献。结果:检索发现临床对照试验相关文献共128篇,其中连花清瘟制剂组8 411例,对照组8 031例。连花清瘟制剂组有