良好的生态环境是人类文明发展的重要基础，生态补偿机制是保护好生态环境的重要手段。从近年来我国流域生态补偿的实践经验看，中央政府的“适当干预”是实现跨省流域生态补偿的关键所在，而汀江-韩江跨省流域作为全国第二个开展生态保护补偿试点，其运行机制和成功模式值得关注与研究。文章通过对汀江-韩江跨省流域治理的案例分析，从探索、完善和巩固三个阶段回顾其开展生态保护补偿试点的过程，总结了汀江-韩江跨省流域治理生态保护补偿试点的运行机制，并试图基于外部性理论与多源流框架的横向生态补偿议程设置展开理论对话，为我国跨省流域生态保护补偿提供可复制、可推广的借鉴经验。研究发现，未来推进流域生态治理、提升其治理效能，政府应从两个方面着手：一是加强协同联动；二是建立有效的法律法规框架。这既是公共治理的责任，也是公共事务的规定，更是公共政策的使命。